哈佛大学,Broad研究院的研究人员明确提出了一种解决问题方法:他们将CRISPR检验与文库检验融合一起,通过统合CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序,平行确认多个基因的基因调控影响,在单个实验中研究数千个单细胞。CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因组编辑技术是生物研究和新型靶向药物研发的有力工具。比如利用CRISPR检验基因(pooledCRISPRscreens),可以通过CRISPRgRNAs靶向成百上千个有所不同的基因,同时编辑许多细胞,然后实验检验编辑细胞,gRNA可以协助确认哪些基因对于生物学起到机制具备至关重要的起到。这种检验方法对于解决问题与细胞生长能力必要涉及的问题最简单,例如检验维护癌细胞免遭化疗或免疫细胞抵抗HIV病毒感染的基因。
相比之下,有可能对于研究基因调控和其它简单的生物机制并不是那么合适,因为要理解多个基因如何协同工作,调控调节细胞状态,就必须针对每个CRISPR靶向基因,分别展开培育,编辑和分析细胞,一看就告诉既繁复,又便宜。来自哈佛大学,Broad研究院的研究人员明确提出了一种解决问题方法:他们将CRISPR检验与文库检验融合一起,通过统合CRISPR基因组编辑与单细胞RNA测序,平行确认多个基因的基因调控影响,在单个实验中研究数千个单细胞。
这一研究成果发布在1月18日的NatureMethods杂志上,领导这一研究的是ChristophBock教授,其研究组利用了尖端的分子技术,建构了一种能协助研究人员看见单细胞测序实验中的CRISPRgRNAs的病毒载体,并使用了最先进设备的基于液滴的单细胞RNA测序方法,高通量的分析了单细胞中上千个基因组编辑事件的影响。
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